Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K1

SPO11, Meiotic recombination protein SPO11, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPO11Q9Y5K1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SPO11Q9Y5K1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SPO11Q9Y5K1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPO11Q9Y5K1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPO11Q9Y5K1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms