Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PHLDA3Q9Y5J5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHLDA3Q9Y5J5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PHLDA3Q9Y5J5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms