Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B5

MTCL1, Microtubule cross-linking factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCL1Q9Y4B5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTCL1Q9Y4B5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTCL1Q9Y4B5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTCL1Q9Y4B5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTCL1Q9Y4B5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms