Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1Q9Y3L3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SH3BP1Q9Y3L3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms