Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
KDM2AQ9Y2K7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
KDM2AQ9Y2K7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
KDM2AQ9Y2K7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
KDM2AQ9Y2K7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KDM2AQ9Y2K7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
KDM2AQ9Y2K7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms