Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y287

ITM2B, Integral membrane protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2BQ9Y287 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITM2BQ9Y287 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ITM2BQ9Y287 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ITM2BQ9Y287 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ITM2BQ9Y287 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms