Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML2Q9UQR0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML2Q9UQR0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML2Q9UQR0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML2Q9UQR0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms