Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EXO1Q9UQ84 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EXO1Q9UQ84 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO1Q9UQ84 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms