Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF9BQ9UPX0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IGSF9BQ9UPX0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
IGSF9BQ9UPX0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms