Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
PHF8Q9UPP1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
PHF8Q9UPP1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
PHF8Q9UPP1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PHF8Q9UPP1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
PHF8Q9UPP1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms