Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPE1

SRPK3, SRSF protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK3Q9UPE1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRPK3Q9UPE1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRPK3Q9UPE1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRPK3Q9UPE1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms