Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NPIPA1Q9UND3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NPIPA1Q9UND3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPIPA1Q9UND3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPIPA1Q9UND3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms