Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
HPCAL4Q9UM19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HPCAL4Q9UM19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HPCAL4Q9UM19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HPCAL4Q9UM19 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms