Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF490Q9ULM2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF490Q9ULM2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF490Q9ULM2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.1 ms