Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LRFN2Q9ULH4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LRFN2Q9ULH4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRFN2Q9ULH4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRFN2Q9ULH4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms