Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ITGA11Q9UKX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ITGA11Q9UKX5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ITGA11Q9UKX5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms