Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO4Q9UKT5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO4Q9UKT5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO4Q9UKT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO4Q9UKT5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO4Q9UKT5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.2 ms