Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
GPATCH8Q9UKJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
GPATCH8Q9UKJ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
GPATCH8Q9UKJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
GPATCH8Q9UKJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
GPATCH8Q9UKJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms