Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MRTO4Q9UKD2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MRTO4Q9UKD2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRTO4Q9UKD2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRTO4Q9UKD2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms