Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FBXL4Q9UKA2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FBXL4Q9UKA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FBXL4Q9UKA2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FBXL4Q9UKA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms