Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF223Q9UK11 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF223Q9UK11 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF223Q9UK11 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF223Q9UK11 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF223Q9UK11 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms