Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SIX4Q9UIU6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SIX4Q9UIU6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SIX4Q9UIU6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SIX4Q9UIU6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms