Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MBD1Q9UIS9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MBD1Q9UIS9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MBD1Q9UIS9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MBD1Q9UIS9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms