Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LAMTOR3Q9UHA4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMTOR3Q9UHA4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LAMTOR3Q9UHA4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms