Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNA9Q9UGM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA9Q9UGM1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNA9Q9UGM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHRNA9Q9UGM1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHRNA9Q9UGM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms