Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.17■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
KDM5BQ9UGL1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC39.1■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
KDM5BQ9UGL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.03■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
KDM5BQ9UGL1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC39■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
KDM5BQ9UGL1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.94■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
KDM5BQ9UGL1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.88■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
KDM5BQ9UGL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms