Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTSFQ9UBX1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CTSFQ9UBX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTSFQ9UBX1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms