Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ABCD2Q9UBJ2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ABCD2Q9UBJ2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ABCD2Q9UBJ2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms