Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC17A7Q9P2U7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC17A7Q9P2U7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC17A7Q9P2U7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms