Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL13Q9P2N7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL13Q9P2N7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLHL13Q9P2N7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KLHL13Q9P2N7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms