Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
LRP2BPQ9P2M1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LRP2BPQ9P2M1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRP2BPQ9P2M1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP2BPQ9P2M1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP2BPQ9P2M1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP2BPQ9P2M1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP2BPQ9P2M1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms