Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.53■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
RRBP1Q9P2E9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
RRBP1Q9P2E9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
RRBP1Q9P2E9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
RRBP1Q9P2E9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
RRBP1Q9P2E9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms