Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTGFRNQ9P2B2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTGFRNQ9P2B2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGFRNQ9P2B2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms