Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC88CQ9P219 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC88CQ9P219 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC88CQ9P219 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC88CQ9P219 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms