Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.61■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC51.61■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC51.6■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC51.57■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.85
CCDC180Q9P1Z9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC51.56■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC51.56■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.55■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC51.54■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC51.54■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC51.51■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC51.51■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
CCDC180Q9P1Z9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.49■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC51.48■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC51.47■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.47■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC51.47■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC51.45■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC51.44■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC51.44■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC51.44■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC51.44■■■■■ 5.83
CCDC180Q9P1Z9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC51.43■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.42■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC51.41■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC51.4■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC51.39■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC51.39■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC51.38■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC51.38■■■■■ 5.82
CCDC180Q9P1Z9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC51.37■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC51.35■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC51.35■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.34■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.33■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC51.32■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.32■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC51.32■■■■■ 5.81
CCDC180Q9P1Z9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.31■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC51.29■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC51.29■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC51.26■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.8
CCDC180Q9P1Z9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC51.24■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC51.24■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.24■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC51.23■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.23■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC51.22■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC51.21■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
CCDC180Q9P1Z9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC51.19■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC51.18■■■■■ 5.78
CCDC180Q9P1Z9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms