Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC3Q9P0I2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC3Q9P0I2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC3Q9P0I2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms