Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EHD3Q9NZN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EHD3Q9NZN3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EHD3Q9NZN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EHD3Q9NZN3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms