Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBP1Q9NZI7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBP1Q9NZI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBP1Q9NZI7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBP1Q9NZI7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms