Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRN3Q9NYV6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRN3Q9NYV6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RRN3Q9NYV6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
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