Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM53CQ9NYF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM53CQ9NYF3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM53CQ9NYF3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FAM53CQ9NYF3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms