Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC5A4Q9NY91 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC5A4Q9NY91 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLC5A4Q9NY91 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC5A4Q9NY91 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms