Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VNN3Q9NY84 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VNN3Q9NY84 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VNN3Q9NY84 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms