Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MCM9Q9NXL9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM9Q9NXL9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MCM9Q9NXL9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM9Q9NXL9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM9Q9NXL9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms