Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
THUMPD1Q9NXG2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THUMPD1Q9NXG2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms