Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW08

POLR3B, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3BQ9NW08 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLR3BQ9NW08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR3BQ9NW08 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
POLR3BQ9NW08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR3BQ9NW08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms