Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATAD3AQ9NVI7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATAD3AQ9NVI7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ATAD3AQ9NVI7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms