Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM30AQ9NV96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM30AQ9NV96 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM30AQ9NV96 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM30AQ9NV96 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms