Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FARSBQ9NSD9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARSBQ9NSD9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARSBQ9NSD9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms