Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHK2Q9NRA0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHK2Q9NRA0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHK2Q9NRA0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHK2Q9NRA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHK2Q9NRA0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPHK2Q9NRA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPHK2Q9NRA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SPHK2Q9NRA0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHK2Q9NRA0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHK2Q9NRA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPHK2Q9NRA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms