Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX7

ITM2C, Integral membrane protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2CQ9NQX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ITM2CQ9NQX7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ITM2CQ9NQX7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITM2CQ9NQX7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITM2CQ9NQX7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms